MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 60479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021830	AAG	2	6	9857	9862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732798
2	NC_021830	ATTA	2	8	9900	9907	50 %	50 %	0 %	0 %	525732798
3	NC_021830	TAA	2	6	9910	9915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732798
4	NC_021830	GTG	4	12	9961	9972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732798
5	NC_021830	ATT	2	6	9984	9989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732798
6	NC_021830	ATGA	2	8	9999	10006	50 %	25 %	25 %	0 %	525732798
7	NC_021830	TC	3	6	10057	10062	0 %	50 %	0 %	50 %	525732798
8	NC_021830	GAA	3	9	10098	10106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732798
9	NC_021830	TAA	2	6	10108	10113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732798
10	NC_021830	GAA	2	6	10115	10120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732798
11	NC_021830	TGG	2	6	10135	10140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732798
12	NC_021830	TTTACC	2	12	10166	10177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525732798
13	NC_021830	GAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732799
14	NC_021830	CAA	2	6	10299	10304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732799
15	NC_021830	CT	4	8	10366	10373	0 %	50 %	0 %	50 %	525732799
16	NC_021830	CTT	2	6	10427	10432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732799
17	NC_021830	AGA	2	6	10448	10453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732799
18	NC_021830	GTT	2	6	10470	10475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732799
19	NC_021830	ATT	2	6	10572	10577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732799
20	NC_021830	A	6	6	10599	10604	100 %	0 %	0 %	0 %	525732799
21	NC_021830	GAG	2	6	10701	10706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525732799
22	NC_021830	GCT	2	6	10716	10721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732799
23	NC_021830	TGA	2	6	10730	10735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732799
24	NC_021830	AATG	2	8	10768	10775	50 %	25 %	25 %	0 %	525732799
25	NC_021830	TGA	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
26	NC_021830	GAT	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
27	NC_021830	GTT	2	6	10829	10834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732800
28	NC_021830	GAAG	2	8	10897	10904	50 %	0 %	50 %	0 %	525732800
29	NC_021830	TTG	2	6	10908	10913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732800
30	NC_021830	ATA	2	6	10914	10919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732800
31	NC_021830	TGA	2	6	10933	10938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
32	NC_021830	TGG	2	6	10992	10997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732800
33	NC_021830	ATG	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
34	NC_021830	GAA	2	6	11063	11068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732800
35	NC_021830	TAT	2	6	11077	11082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732800
36	NC_021830	ATT	2	6	11134	11139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732800
37	NC_021830	TG	3	6	11231	11236	0 %	50 %	50 %	0 %	525732800
38	NC_021830	GC	3	6	11257	11262	0 %	0 %	50 %	50 %	525732800
39	NC_021830	ACA	2	6	11294	11299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732800
40	NC_021830	TA	3	6	11356	11361	50 %	50 %	0 %	0 %	525732800
41	NC_021830	TGA	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
42	NC_021830	ATT	2	6	11576	11581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732800
43	NC_021830	AAG	2	6	11589	11594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732800
44	NC_021830	A	6	6	11661	11666	100 %	0 %	0 %	0 %	525732800
45	NC_021830	TGAA	2	8	11667	11674	50 %	25 %	25 %	0 %	525732800
46	NC_021830	T	6	6	11698	11703	0 %	100 %	0 %	0 %	525732800
47	NC_021830	GAGAA	2	10	11704	11713	60 %	0 %	40 %	0 %	525732800
48	NC_021830	AGA	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732800
49	NC_021830	ATG	2	6	11788	11793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
50	NC_021830	ATG	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
51	NC_021830	AAG	2	6	11872	11877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
52	NC_021830	GAACA	2	10	11908	11917	60 %	0 %	20 %	20 %	525732801
53	NC_021830	TTA	2	6	11922	11927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732801
54	NC_021830	GCG	2	6	11955	11960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525732801
55	NC_021830	CT	3	6	11965	11970	0 %	50 %	0 %	50 %	525732801
56	NC_021830	GCA	2	6	11999	12004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732801
57	NC_021830	GAC	2	6	12044	12049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732801
58	NC_021830	A	6	6	12072	12077	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
59	NC_021830	GAACA	2	10	12130	12139	60 %	0 %	20 %	20 %	525732801
60	NC_021830	GGC	2	6	12246	12251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525732801
61	NC_021830	ACAA	2	8	12275	12282	75 %	0 %	0 %	25 %	525732801
62	NC_021830	GTC	2	6	12406	12411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732801
63	NC_021830	GAA	2	6	12416	12421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
64	NC_021830	CAA	2	6	12483	12488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732801
65	NC_021830	TGT	2	6	12554	12559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732801
66	NC_021830	GTG	2	6	12577	12582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732801
67	NC_021830	A	6	6	12600	12605	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
68	NC_021830	TATT	2	8	12643	12650	25 %	75 %	0 %	0 %	525732801
69	NC_021830	TGG	2	6	12677	12682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732801
70	NC_021830	GCC	2	6	12719	12724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525732801
71	NC_021830	GTG	2	6	12733	12738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732801
72	NC_021830	CAA	2	6	12757	12762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732801
73	NC_021830	AT	3	6	12782	12787	50 %	50 %	0 %	0 %	525732801
74	NC_021830	TGC	2	6	12797	12802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732801
75	NC_021830	GA	3	6	12807	12812	50 %	0 %	50 %	0 %	525732801
76	NC_021830	AGA	2	6	12848	12853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
77	NC_021830	TGA	2	6	12917	12922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
78	NC_021830	GCT	2	6	12933	12938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732801
79	NC_021830	TGA	2	6	13001	13006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
80	NC_021830	A	6	6	13046	13051	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
81	NC_021830	A	6	6	13086	13091	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
82	NC_021830	AGC	2	6	13130	13135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732801
83	NC_021830	A	6	6	13164	13169	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
84	NC_021830	AGA	2	6	13175	13180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
85	NC_021830	AGA	2	6	13232	13237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
86	NC_021830	TTG	2	6	13240	13245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732801
87	NC_021830	GTT	2	6	13251	13256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732801
88	NC_021830	TGC	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732801
89	NC_021830	CG	3	6	13482	13487	0 %	0 %	50 %	50 %	525732801
90	NC_021830	GAT	2	6	13520	13525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
91	NC_021830	CTC	2	6	13582	13587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525732801
92	NC_021830	GAA	2	6	13605	13610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
93	NC_021830	AGT	2	6	13652	13657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
94	NC_021830	GGT	2	6	13751	13756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732801
95	NC_021830	TCA	2	6	13774	13779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732801
96	NC_021830	TGA	2	6	13931	13936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
97	NC_021830	AAG	2	6	14128	14133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
98	NC_021830	GAA	2	6	14151	14156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
99	NC_021830	A	7	7	14228	14234	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
100	NC_021830	A	6	6	14243	14248	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
101	NC_021830	AAC	2	6	14252	14257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732801
102	NC_021830	A	6	6	14261	14266	100 %	0 %	0 %	0 %	525732801
103	NC_021830	AACA	2	8	14281	14288	75 %	0 %	0 %	25 %	525732801
104	NC_021830	TG	3	6	14458	14463	0 %	50 %	50 %	0 %	525732802
105	NC_021830	ATGG	2	8	14491	14498	25 %	25 %	50 %	0 %	525732802
106	NC_021830	A	7	7	14554	14560	100 %	0 %	0 %	0 %	525732802
107	NC_021830	TTA	2	6	14744	14749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732802
108	NC_021830	A	6	6	14783	14788	100 %	0 %	0 %	0 %	525732802
109	NC_021830	TA	3	6	14795	14800	50 %	50 %	0 %	0 %	525732802
110	NC_021830	GAA	2	6	14807	14812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732802
111	NC_021830	CAAA	2	8	14818	14825	75 %	0 %	0 %	25 %	525732802
112	NC_021830	GCGG	2	8	14833	14840	0 %	0 %	75 %	25 %	525732802
113	NC_021830	GATT	2	8	14911	14918	25 %	50 %	25 %	0 %	525732802
114	NC_021830	ATC	2	6	14964	14969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732802
115	NC_021830	TTG	2	6	15066	15071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732802
116	NC_021830	AAGG	2	8	15083	15090	50 %	0 %	50 %	0 %	525732802
117	NC_021830	TCA	2	6	15157	15162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732802
118	NC_021830	GAA	2	6	15281	15286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732802
119	NC_021830	GGAA	2	8	15328	15335	50 %	0 %	50 %	0 %	525732802
120	NC_021830	TAA	2	6	15421	15426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732802
121	NC_021830	AGC	2	6	15499	15504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732802
122	NC_021830	TGG	2	6	15505	15510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732802
123	NC_021830	CAGT	2	8	15549	15556	25 %	25 %	25 %	25 %	525732802
124	NC_021830	CAA	2	6	15582	15587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732802
125	NC_021830	TCG	2	6	15634	15639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732802
126	NC_021830	AAC	2	6	15654	15659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732802
127	NC_021830	AAG	2	6	15666	15671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732802
128	NC_021830	GAA	2	6	15781	15786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732802
129	NC_021830	GT	3	6	15956	15961	0 %	50 %	50 %	0 %	525732803
130	NC_021830	T	6	6	15961	15966	0 %	100 %	0 %	0 %	525732803
131	NC_021830	TAAT	2	8	16041	16048	50 %	50 %	0 %	0 %	525732803
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497	NC_021830	AC	3	6	34696	34701	50 %	0 %	0 %	50 %	525735304
498	NC_021830	AAG	2	6	34717	34722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735304
499	NC_021830	TGAAA	2	10	34731	34740	60 %	20 %	20 %	0 %	525735304
500	NC_021830	TTG	2	6	34765	34770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525735305

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